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研究人员探讨转座因子在心肌炎中的作用
发布时间：2024-05-16 10:25:22李纨君来源：
导读 转座元件(TE)在历史上被视为基因组寄生虫，现在已被认为是细胞身份和功能的重要贡献者，特别是在免疫调节方面。哺乳动物基因组包含大量的
转座元件(TE)在历史上被视为基因组寄生虫，现在已被认为是细胞身份和功能的重要贡献者，特别是在免疫调节方面。
哺乳动物基因组包含大量的 TE。这些元素的多样性和丰度影响着基因组的结构、功能和进化。它们通过改变转录因子结合位点和创造新的增强子活性来影响基因调控网络。
越来越多的证据强调 TE 在各种疾病中的关键作用，特别是在调节免疫力方面。然而，在心肌炎的背景下，人们对 TE 的影响明显缺乏关注，这凸显了一个潜在的研究领域，可以为驱动这种心脏病的分子机制提供新的见解。
在《繁殖与育种》杂志上发表的一项研究中，湖南师范大学的研究小组利用 RNA-Seq 和单细胞 RNA-Seq 数据来识别与心肌炎相关的关键 TE。
该团队使用公开数据库来探索 TE 在心肌炎中的作用。分析了 RNA 测序数据和单细胞测序数据，重点关注实验性自身免疫性心肌炎 (EAM) 的小鼠模型。 RNA-Seq 分析揭示了心脏组织中一系列免疫基因的大幅上调。
“我们利用心脏免疫细胞的单细胞测序进一步研究，确定了心脏中不同类型免疫细胞中某些转座元件(TE)的特异性表达，”该研究的第一作者 Sixing Chen 说。 “我们观察到 ERVB7-1 的表达总体增加。”
EAM 模型中跨不同细胞的 LTR-MM 转座子表明该转座子对该疾病背景下的免疫反应具有广泛影响。
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